金融機構應當在機構總部設立首席合規官，首席合規官是高級管理人員，接受機構董事長和行長（總經理）直接領導，向董事會負責。此外，原則上應當在省級分支機構或者一級分支機構設立合規官，合規官是本級機構高級管理人員，接受本級機構行長（總經理）直接領導。
辦法指，由金融機構行長（總經理）兼任首席合規官，以及由金融機構省級分支機構或者一級分支機構行長（總經理）兼任合規官的，不受辦法規定的首席合規官或者合規官的任職條件限制，不需要另行取得任職資格許可。
至於首席合規官及合規官不得負責管理金融機構的前台業務、財務、資金運用、內部審計等可能與合規管理存在職責沖突的部門。金融機構行長（總經理）兼任首席合規官、省級分支機構或一級分支機構行長（總經理）兼任合規官的除外。
辦法指，金融機構應當制定合規管理制度，按照「分級管理、逐級負責」的要求，完善合規管理組織架構，金融機構的董事會負責確定合規管理目標，對合規管理的有效性承擔最終責任。金融機構的高級管理人員負責落實合規管理目標，對主管或者分管領域業務合規性承擔領導責任。
此外，金融機構的董事會履行合規管理職責包括審議批准合規管理基本制度；決定合規管理部門的設置；決定聘任、解聘首席合規官，建立與首席合規官的直接溝通機制；決定解聘對發生重大違法違規行為、重大合規風險負有主要責任或者領導責任的高級管理人員；評估合規管理有效性和合規文化建設水平，督促解決合規管理和合規文化建設中存在的重大問題等，而董事會可以下設合規委員會或其他專門委員會履行合規管理相關職責。
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